关于购买农村自建房的问题

题主说得非常清楚，这件事情总的来讲并不复杂，我先逐一回答，再提出我的建议，仅供参考。
1、说明你是无房户，购房属第一次置业；
2、说明你所处地段是城乡结合部，或是“城中村”，现在刚改为涉农街道，正处在城市化加速阶段；
3、4说明了地产、房产性质，可谓一喜一忧：
喜的是该土地为国有土地，而不是集体土地，如是集体土地，那是肯定不能交易过户的，时下比较尴尬的“小产权房”就属此类。但庆幸的是，你的这宗地不是集体的。
忧的是该土地性质为划拨，不是出让，这仍是不能入市交易的一个障碍。但这个障碍并非完全不能逾越，关键是要通过正常途径，将土地性质由划拨转为出让。但这对你来说，将是一个非常棘手的问题：如果**不同意，或在此有统一规划（比如修路），土地变性将很难实现。
5、说明了协议内容，抛开其他因素，条款基本尚可，还应加一句“其他未尽事宜，由双方协商解决”。但此协议仍属违规交易，原因就在于土地性质。不过一旦签订，协议对双方当事人还是具有法律效力的，也就是可以用作今后打官司的证据。
6、说明付款凭证是具备的，也是重要证据。
7、说明了一个可大可小的问题，名字很重要，你最好查看一下对方**，查实“权”、“全”之误，如是同一个人，则事小，找对方确认修改协议签名，并重压印章或指印即可；如不是同一人，则事大，有可能涉嫌欺诈，不过这种可能性似乎不大。
8、购买农村自建房虽有违规之嫌，但不与户口性质相关，可不考虑。
9、既然没有房产证，就不能过户，因此，拆迁赔偿肯定还是要由对方出面，这也应该在协议中有所约定，如无可与对方签个临时补充协议，约定赔偿全部归你。协议无效的说法欠妥，只能说是违规，但仍具有法律效力。有后种言论的，一般是在补偿价格高于买房价格时，对方有反悔之意时最易出现，所以你应该提前在协议中约定好，即便对方毁约，你还是可以争取追回既得利益的。
10、农村自建房可以申请办理房产证，但用于交易肯定属于违规。不能正常的交易过户，自然就不能以你的名义办理房产证。
综上所述，既然协议已签，冒风险肯定是必然的，不过应该尽量把责任和义务约定好，尤其是关于遇到拆迁补偿时如何应对的条款，必须尽快落实成白纸黑字，这样才能避免以后扯皮。
当然，如果想全身而退，就只能与对方协商终约，拿回自己的钱，另寻他法购房。（其实在面临拆迁时，对方很容易反悔的，趁这时候谈退出是最佳时机，谈得好可免去你的违约赔付，拿回本金）。
教训：买房是终身大事，不能贪小便宜、吃大亏，弄不好会血本无归的！即使有理，真要打起官司来，也是很伤精伤神的，得不偿失啊。